幕府后期，日本史上相当有人气的其中一个团体，一方面也是令勤王志士们闻风丧胆的年轻集团－新选组。以局长近藤勇为主轴，日本的未来就寄托在他们身上，是描述贯彻自己的信念的幕末青春物语。
曾经的棒球名校二子玉川高中因为一起恶性斗殴事件被取消了参赛资格。丧失比赛资格的同时，也让棒球队的一众成员安仁屋（市原隼人 饰）、御子柴（小出惠介 饰）、新庄（城田优 饰）、若菜（高冈苍甫 饰）等丢失了自己的棒球梦，成为了让学校头疼的问题学生。
21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。
月野兔（沢井美优 饰）是一位个性活泼开朗，热情善良，内心里充满了正义感的初中生。一次偶然中，她遇见了一只名叫露娜的黑猫，让月野兔感到不可思议的时，露娜竟然会说人类的语言。露娜告诉月野兔，她的真实身份是拥有强大力量的水手月亮。
