大飞与黑豹都在洪爷主持的犯罪集团里工作，警方派卧底阿星搜集集团的犯罪证据，可惜被大飞识破了，星取得机密磁碟后，交给女友阿ANN，并叮嘱她马上离开香港，她返到吉隆坡后才知道阿星已被杀害。大飞一直与洪爷养子阿豪争宠，故指阿豪与差婆杨琳来往，阿豪只好承诺不管用任何手段，都会找回磁碟。阿豪估计磁碟落在阿ANN手中，所以到大马找阿ANN，而此时香港警方对阿星被杀一案，也非常关注……

民国初年，袁世凯为复辟，派人去少林寺抢夺“金刚经”，以罗锐为首的四名少林武僧，为保护“真经”逃离寺院，袁党一路追杀，将罗锐的三名兄弟杀害，罗锐走投无路，只好和袁党一伙决一死战。罗锐的武功非常出色，尤其腿功了得，其气质也异常冷峻，与李小龙颇为近似。

四个汪洋大盗，凌、洪、卢及谭到夜总会寻欢，结识了重义气的舞女程思，回洒店门前，被警察伏击，原来四人劫得价值一千万的钻石。凌机智逃脱，而卢及谭二人则被捕。凌利用程之义气，找寻华及由大陆偷渡来港的卢三妹。后知卢三妹被迫为倡，程与华将卢三妹赎出，后到监狱探望卢，卢将钻石所在处告诉了三妹。但此事却被洪知道，更抢先一步前往监狱接三妹……

20世纪90年代初，香江怒海，一代枭雄倪永孝（吴镇宇 饰）雄霸黑道，风头无两。以此为契机，青春年少的警校学生陈永仁（余文乐 饰）肩负机密使命潜入黑道，从此开始了他无法回头的黑暗人生。与此同时，精明狡猾的黑道头目韩琛（曾志伟 饰）密令弟子刘建明（陈冠希 饰）考入警校，成为他日后纵横江湖最重要的一枚棋子。转眼十年，风云变幻。韩琛早已成为新千年的黑道霸主。一起毒品交易的攻防战，令他和黄督察（黄秋生 饰）都敏锐地察觉到“内鬼”的存在。

广州提督之子苏灿（周星驰 饰）在考取武状元时，被人设计陷害沦为乞丐。因为丐帮四大长老杀了自己的教主，入主朝廷的天理教太乙真人四处迫害丐帮，加上丐帮帮主阵亡令打狗棒法失传，丐帮一时四分五裂群龙无首。在心仪苏灿的如霜（张敏 饰）的暗中帮助下，传功长老选中苏灿为丐帮接班人，传以打狗律 法要诀。苏灿学艺成功后，成为新任帮主，开始团结各地丐帮会员自强，共同奋力对抗天理教。太乙真人（徐少强  饰）欲拥兵自立，预谋在皇帝狩猎之时下手行刺，不料消息走露传到苏灿耳中。

传说远古一段不为人知的时间。无间道长风烛残年，但为镇魔伏妖长年累月驻守青峰山，守住魔洞出口。十年之约来临，黑将军现身与无间道长大战数十回合，虽然难分高下及胜负，但却两败俱伤，黑将军因元气大伤而化为婴孩，无间道长内伤下亦知时日无多，就将毕生功力传授随身爱徒无邪，并要无邪将婴孩抚养成长，归入正派，重整神剑门。数年后太子夜视天象，见天有异像，急召神剑门无邪出征灭魔并派朱雀，玄武随行。在众门徒长老反对下无邪坚持带住师弟无界前往青峰山，一来见识外界，二来作一个考验，看无界是否有魔之缘，无界虽然是魔之子，长大后人品纯良不爱学武却爱学医。路途遥远惊险，邪魔的吸引连场激斗对无邪无界是一个挑战。前往青峰山脏洞，鬼泉镇是必经之路。鬼泉镇荒凉无人，无邪无界，朱雀及玄武决定在鬼泉镇渡宿一晚，明早再入青峰山，暗黑邪王终于出现，并掳走无界……