本作品讲述了在警察“机动搜查队”，机动能力和运动神经首屈一指、但却没有刑事搜查经验也缺乏刑警常识的伊吹蓝（绫野刚 饰），观察和社交能力突出,但却不信任自己和别人的理性的刑警、志摩一未（星野源 饰），主角二人以24小时的时限内破案为目标的故事。 标题中的“MIU”是Mobile Investigative Unit（机动搜查队）的首字母，“404”是两人饰演机动搜查队员的呼叫信号。
曾经的棒球名校二子玉川高中因为一起恶性斗殴事件被取消了参赛资格。丧失比赛资格的同时，也让棒球队的一众成员安仁屋（市原隼人 饰）、御子柴（小出惠介 饰）、新庄（城田优 饰）、若菜（高冈苍甫 饰）等丢失了自己的棒球梦，成为了让学校头疼的问题学生。
21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。
月野兔（沢井美优 饰）是一位个性活泼开朗，热情善良，内心里充满了正义感的初中生。一次偶然中，她遇见了一只名叫露娜的黑猫，让月野兔感到不可思议的时，露娜竟然会说人类的语言。露娜告诉月野兔，她的真实身份是拥有强大力量的水手月亮。
